Genome-wide association study identifies five new susceptibility loci for prostate cancer in the Japanese population

Nature Genetics
Published online: 1 August 2010 | doi:10.1038/ng.635
Genome-wide association study identifies five new susceptibility loci for prostate cancer in the Japanese population
Ryo Takata1,2, Shusuke Akamatsu1,3, Michiaki Kubo4, Atsushi Takahashi5, Naoya Hosono4, Takahisa Kawaguchi6, Tatsuhiko Tsunoda6, Johji Inazawa7, Naoyuki Kamatani5, Osamu Ogawa3, Tomoaki Fujioka2, Yusuke Nakamura8 & Hidewaki Nakagawa1

Abstract
Prostate cancer is one of the most common malignancies in males throughout the world1, and its incidence is increasing in Asian countries. We carried out a genome-wide association study and replication study using 4,584 Japanese men with prostate cancer and 8,801 control subjects. From the thirty-one associated SNPs reported in previous genome-wide association studies in European populations, we confirmed the association of nine SNPs at P < 1.0 × 10−7 and ten SNPs at P < 0.05 in the Japanese population. The remaining 12 SNPs showed no association (P > 0.05). In addition, we report here five new loci for prostate cancer susceptibility, at 5p15 (λ-corrected probability PGC = 3.9 × 10−18), GPRC6A/RFX6 (PGC = 1.6 × 10−12), 13q22 (PGC = 2.8 × 10−9), C2orf43 (PGC = 7.5 × 10−8) and FOXP4 (PGC = 7.6 × 10−8). These findings advance our understanding of the genetic basis of prostate carcinogenesis and also highlight the genetic heterogeneity of prostate cancer susceptibility among different ethnic populations.



GENÉTICA
Identifican nuevas alteraciones genéticas relacionadas con el cáncer de próstata en pacientes japoneses
JANO.es · 04 Agosto 2010 09:32

Estas regiones no se habían detectado en poblaciones europeas, lo que evidencia variaciones de susceptibilidad entre etnias.

Una investigación japonesa de la Universidad de Tokio y el Centro Riken de Medicina Genómica, en Yokohama, ha descubierto cinco nuevas alteraciones genéticas relacionadas con el cáncer de próstata que hasta el momento no se habían identificado en la población europea.

Según publican en un artículo de la revista Nature Genetics, es la primera vez que se analiza el perfil genético de estos tumores en Japón ya que hasta el momento presentaba una de las tasas de afectados más bajas del mundo. Sin embargo, parece que el estilo de vida occidental y el progresivo envejecimiento de la población han favorecido un incremento de casos y, al mismo tiempo, un mayor interés por este tipo de cáncer.

Así, en un estudio genético a 4.584 japoneses con este tumor se detectaron 31 polimorfismos de nucleótido único (SNP), 19 de ellos también presentes en estudios previos con población europea y otros 12 que no guardaban ninguna relación. Junto a estos, hubo cinco nuevas regiones genómicas asociadas con el cáncer de próstata que no se había detectado en los primeros estudios sobre las poblaciones europeas, lo que evidencia la variación en la susceptibilidad entre diferentes etnias.

El objetivo, según indican estos expertos, es realizar una evaluación de riesgo más precisa en función de cada población para mejorar los protocolos de detección y alcanzar un tratamiento clínico más eficaz.


Nature Genetics; Published online 1 August 2010; doi:10.1038/ng.635
http://www.nature.com/ng/journal/vaop/ncurrent/full/ng.635.html

Centro Riken de Medicina Genómica
http://www.src.riken.jp/english/

Nature Genetics
http://www.nature.com/ng/index.html

Universidad de Tokio
http://www.u-tokyo.ac.jp/index_e.html