Research
The membrane-spanning 4-domains, subfamily A (MS4A) gene cluster contains a common variant associated with Alzheimer's Disease
Carmen Antunez, Merce Boada, Antonio Gonzalez-Perez, Javier Gayan, Reposo Ramirez-Lorca, Juan Marin, Isabel Hernandez, Concha Moreno-Rey, Francisco Jesus Moron, Jesus Lopez-Arrieta, Ana Mauleon, Maitee Rosende-Roca, Fuensanta Noguera-Perea, Agustina Legaz-Garcia, Laura Vivancos-Moreau, Juan Velasco, Jose Miguel Carrasco, Montserrat Alegret, Martirio Antequera-Torres, Salvadora Manzanares, Alejandro Romo, Irene Blanca, Susana Ruiz, Anna Espinosa, Sandra Castano, Blanca Garcia, Begona Martinez-Herrada, Georgina Vinyes, Asuncion Lafuente, James T Becker et al.
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Genome Medicine 2011, 3:33 doi:10.1186/gm249
Published: 31 May 2011
Abstract (provisional)
Background
In order to identify novel loci associated to Alzheimer's Disease (AD) we conducted a genome-wide association study (GWAS) in the Spanish population.
Methods
We genotyped 1128 individuals using the Affymetrix Nsp I 250K chip. A sample of 327 sporadic AD patients and 801 controls with unknown cognitive status from the Spanish general population were included in our initial study. To increase the power of the study, we combined our results with those of four other public GWAS datasets by applying identical quality control filters, and the same imputation methods which were then analyzed with a global meta-GWAS. A replication sample with 2200 sporadic AD patients and 2301 controls was genotyped to confirm our GWAS findings.
Results
Meta-analysis of our data and independent replication datasets allowed us to confirm a novel genome-wide significant association of AD with membrane-spanning 4-domains subfamily A (MS4A) gene cluster (rs1562990, P=4.40E-11, odds ratio (OR)=0.88, c.i.95%[0.85-0.91], n=10,181 cases and 14,341 controls).
Conclusions
Our results underscore the importance of international efforts combining GWAS datasets to isolate genetic loci for complex diseases.
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NEUROLOGÍA
Actualidad Ultimas noticias - JANOes -
Hallado un gen que favorece la progresión del Alzheimer
JANO.es · 02 Junio 2011 13:31
.La variante descubierta corresponde al agrupamiento génico MS4A, que ejercería un papel protector para la enfermedad.
Recientes investigaciones han identificado cinco genes asociados con el Alzheimer, entre los que figura un nuevo locus genético localizado en la región MS4A, en el cromosoma 11, que facilitaría la progresión de la enfermedad. Ya son diez los genes conocidos que se relacionan con esta enfermedad.
Los investigadores, cuyas conclusiones han sido publicadas en Genome Medicine, han analizado más de un millón de marcadores genéticos en 1.100 individuos. El trabajo ha contado con el patrocinio de la Fundación Alzheimur y de la Fundació ACE. Institut Català de Neurociències Aplicades de Barcelona, que ha puesto a disposición de los analistas 2.154 muestras de su propia colección, una de las más importantes de Europa.
El equipo, formado por expertos de España y EUA, confirmó la presencia de mutaciones asociadas con el Alzheimer, incluyendo, entre otras, una nueva variante contenida en el agrupamiento génico MS4A que contribuiría al avance de la enfermedad.
Fuentes de la investigación señalan que “varios de los 16 genes de la agrupación MS4A están implicados en las actividades del sistema inmune, y probablemente están involucrados en las alergias y enfermedades autoinmunes. En particular, MS4A2 se ha relacionado con el asma por intolerancia a la aspirina. Nuestra investigación proporciona nuevas pruebas acerca del papel del sistema inmune en la progresión de la enfermedad del Alzheimer”.
Genome Medicine (2011); doi:10.1186/gm249
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Fundació ACE. Institut Català de Neurociències Aplicades de Barcelona
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